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当今社会人士越关心食品安全，就越重视普通食品饮料的质量和食品材料的卫生程度。 同时，食品尽量避免使用添加剂和防腐剂备受关注。 经过某种处理改变了微生物正常补充的食品特别容易被环境微生物侵蚀。 例如，酸奶、奶酪、其他奶制品、果汁、加味牛奶、主菜。 蘑菇的生长也在无尘车间进行，有时会防止条件性性病原孢子的生长过剩。
例如，一些大规模无尘车间的设施要求在100000级(ISO8和9级)以上。 在美国，一家奶酪公司在爱达荷州杰宁建造了3600万美元、面积140000平方英尺的奶酪和乳清制品工厂。 这个工厂有四个主要的加热通风系统，每分钟能输送130000立方英尺过滤效率95%的空气，每小时通风15~20次。 该食品净化厂采用正压，空气从加工区流出。
例如，美国联邦农业部的研究表明，美国约5%的肉食产品感染单核细胞增生性李氏菌(Listeriamonocytogenes )，致命感染人类，引发败血症、脑膜炎和脑膜脑炎(meningo-encephalitis ) 即肉制品市场的扩大是增加食品无尘车间技术需求的一个因素。
由此可见，无尘车间已成为食品安全生产的重要关口。
